Разработка мультиплексной системы для определения 11 генетических маркеров предрасположенности к развитию ожирения
https://doi.org/10.29235/1561-8331-2021-57-3-300-309
Аннотация
С помощью метода минисеквенирования (SNaPshot анализ) разработана система для определения 11 генетических маркеров, связанных с риском развития ожирения: rs10852521, rs11075990, rs1121980, rs1421085, rs1477196, rs17817449, rs3751812, rs7206790, rs8047395, rs9940128 (ген FTO) и rs1137101 (ген LEPR). Условия проведения реакций амплификации и минисеквенирования, а также составы реакционных смесей оптимизированы так, чтобы проводить анализ по всем 11 маркерам одновременно. Полученная система апробирована и показала высокую степень воспроизводимости и чувствительности, необходимой для определения данных полиморфных вариантов.
При поддержке: Финансирование работ осуществлялось в рамках Мероприятий 6 и 9 НТП Союзного государства «ДНК- идентификация».
Об авторах
Г. В. Сергеев
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
Геннадий Валерьевич Сергеев – канд. хим. наук, зав. лаб.
ул. Акад. В. Ф. Купревича, 5/2, 220141, Минск
И. В. Гайдукевич
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
Ирина Витальевна Гайдукевич – канд. хим. наук, ст. науч. сотрудник
ул. Акад. В. Ф. Купревича, 5/2, 220141, Минск
А. М. Горькавая
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
Анна Михайловна Горькавая – науч. сотрудник
ул. Акад. В. Ф. Купревича, 5/2, 220141, Минск
М. Д. Амельянович
Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
Максим Дмитриевич Амельянович – науч. сотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, Минск
И. Б. Моссэ
Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
Ирма Борисовна Моссэ – д-р биол. наук, профессор, гл. науч. сотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, Минск
С. А. Усанов
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
Сергей Александрович Усанов – член-корреспондент, д-р хим. наук, профессор, гл. науч. сотрудник
ул. Акад. В. Ф. Купревича, 5/2, 220141, Минск
Список литературы
1. Информационные бюллетени: Ожирение и избыточный вес [Электронный ресурс] // Всемирная организация здравоохранения. – Режим доступа: https://www.who.int/ru/news-room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight. – Дата доступа: 07.04.2021.
2. Boonmanunt, S. Evaluation of the effectiveness of behavioural economic incentive programmes for the promotion of a healthy diet and physical activity: a protocol for a systematic review and network meta-analysis / S. Boonmanunt [et al.] // BMJ. – 2020. – Vol. 10, № 12. – P. e046035. https://doi.org/10.1136/bmjopen-2020-046035
3. Проблема ожирения в Европейском регионе ВОЗ / ВОЗ; редкол.: F. Branca [и др.]. – Копенгаген: ВОЗ Европа, 2009. – 392 с.
4. Crystal structure of the FTO protein reveals basis for its substrate specificity / Z. Han [et al.] // Nature. – 2010. – Vol. 464, № 7292. – P. 1205–209. https://doi.org/10.1038/nature08921
5. A common variant in the FTO gene is associated with body mass index and predisposes to childhood and adult obesity / T. M. Frayling [et al.] // Science. – 2007. – Vol. 316. – P. 889–894. https://doi.org/10.1126/science.1141634
6. FTO gene polymorphisms and obesity risk: a meta-analysis / S. Peng [et al.] // BMC medicine. – 2011. – Vol. 9, N 1. https://doi.org/10.1186/1741-7015-9-71
7. Genome-wide association scan shows genetic variants in the FTO gene are associated with obesity-related traits / A. Scuteri [et al.] // Plos. Genetics. – 2007. – Vol. 3. – P. 1200–1210. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.0030115
8. Replication of the association of common rs9939609 variant of FTO with increased BMI in an Australian adult twin population but no evidence for gene by environment (G × E) interaction / B. K. Cornes [et al.] // International Journal of Obesity. – 2009. – Vol. 33. – P. 75–79. https://doi.org/10.1038/ijo.2008.223
9. FTO variants are associated with obesity in the Chinese and Malay populations in Singapore / J. T. Tan [et al.] // Diabetes. – 2008. – Vol. 57. – P. 2851–2857. https://doi.org/10.2337/db08-0214
10. Freathy, R. M. Common variation in the FTO gene alters diabetes-related metabolic traits to the extent expected given its effect on BMI / R. M. Freathy // Diabetes. – 2008. – Vol. 57. – P. 1419–1426. https://doi.org/10.2337/db07-1466
11. Variations in the FTO gene are associated with severe obesity in the Japanese / K. Hotta [et al.] // J. Hum. Genet. – 2008. – Vol. 53, № 6. – P. 546–553. https://doi.org/10.1007/s10038-008-0283-1
12. Genetic association of SNPs in the FTO gene and predisposition to obesity in Malaysian Malays / Y.D. Apalasamy [et al.] // Braz. J. Med. Biol. Res. – 2012. – Vol. 45, № 12. – P. 1119–1126. https://doi.org/10.1590/s0100-879x2012007500134
13. Physical Activity and the Association of Common FTO Gene Variants With Body Mass Index and Obesity / E. Rampersaud [et al.] // Arch. Intern. Med. – 2008. – Vol. 168, № 16. – P. 1791–1797. https://doi.org/10.1001/archinte.168.16.1791
14. Rs7206790 and rs11644943 in FTO gene are associated with risk of obesity in Chinese school-age population / Y. Xu [et al.] // PLoS One. – 2014. – Vol. 9, № 9. – P. e108050. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0108050
15. Replication of 6 obesity genes in a meta-analysis of genome-wide association studies from diverse ancestries / L. J. Tan [et al.] // PLoS One. – 2014. – Vol. 9, № 5. – P. e96149. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0096149
16. Analysis of FTO gene variants with obesity and glucose homeostasis measures in the multiethnic Insulin Resistance Atherosclerosis Study cohort / M. R. Wing [et al.] // Int. J. Obes (Lond). – 2011. – Vol. 35, № 9. – P. 1173–1182. https://doi.org/10.1038/ijo.2010.244
17. Leptin G-2548A and leptin receptor Q223R gene polymorphisms are not associated with obesity in Romanian subjects / A. Constantin [et al.] // Biochem. Biophys. Res. Commun. – 2010. – Vol. 391. – P. 282–286. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2009.11.050
18. Effect of genetic variation in the leptin gene promoter and the leptin receptor gene on obesity risk in a population-based case-control study in Spain / O. Portoles [et al.] // Eur. J. Epidemiol. – 2006. – Vol. 21. – P. 605–612. https://doi.org/10.1007/s10654-006-9045-6
19. Variations in the obesity gene “LEPR” contribute to risk of type 2 diabetes mellitus: evidence from a meta-analysis / M. M. Yang [et al.] // Journal of diabetes research. – 2016. – Article ID 5412084. – P. 1–12. https://doi.org/10.1155/2016/5412084
Рецензия
Просмотров: 604
Послать статью по эл. почте 