Разработка мультиплексной системы для определения 11 генетических маркеров предрасположенности к развитию ожирения
https://doi.org/10.29235/1561-8331-2021-57-3-300-309
Анатацыя
С помощью метода минисеквенирования (SNaPshot анализ) разработана система для определения 11 генетических маркеров, связанных с риском развития ожирения: rs10852521, rs11075990, rs1121980, rs1421085, rs1477196, rs17817449, rs3751812, rs7206790, rs8047395, rs9940128 (ген FTO) и rs1137101 (ген LEPR). Условия проведения реакций амплификации и минисеквенирования, а также составы реакционных смесей оптимизированы так, чтобы проводить анализ по всем 11 маркерам одновременно. Полученная система апробирована и показала высокую степень воспроизводимости и чувствительности, необходимой для определения данных полиморфных вариантов.
Аб аўтарах
Г. Сергеев
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
И. Гайдукевич
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
А. Горькавая
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
М. Амельянович
Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
И. Моссэ
Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
С. Усанов
Институт биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси
Беларусь
Беларусь
Спіс літаратуры
1. Информационные бюллетени: Ожирение и избыточный вес [Электронный ресурс] // Всемирная организация здравоохранения. – Режим доступа: https://www.who.int/ru/news-room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight. – Дата доступа: 07.04.2021.
2. Boonmanunt, S. Evaluation of the effectiveness of behavioural economic incentive programmes for the promotion of a healthy diet and physical activity: a protocol for a systematic review and network meta-analysis / S. Boonmanunt [et al.] // BMJ. – 2020. – Vol. 10, № 12. – P. e046035. https://doi.org/10.1136/bmjopen-2020-046035
3. Проблема ожирения в Европейском регионе ВОЗ / ВОЗ; редкол.: F. Branca [и др.]. – Копенгаген: ВОЗ Европа, 2009. – 392 с.
4. Crystal structure of the FTO protein reveals basis for its substrate specificity / Z. Han [et al.] // Nature. – 2010. – Vol. 464, № 7292. – P. 1205–209. https://doi.org/10.1038/nature08921
5. A common variant in the FTO gene is associated with body mass index and predisposes to childhood and adult obesity / T. M. Frayling [et al.] // Science. – 2007. – Vol. 316. – P. 889–894. https://doi.org/10.1126/science.1141634
6. FTO gene polymorphisms and obesity risk: a meta-analysis / S. Peng [et al.] // BMC medicine. – 2011. – Vol. 9, N 1. https://doi.org/10.1186/1741-7015-9-71
7. Genome-wide association scan shows genetic variants in the FTO gene are associated with obesity-related traits / A. Scuteri [et al.] // Plos. Genetics. – 2007. – Vol. 3. – P. 1200–1210. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.0030115
8. Replication of the association of common rs9939609 variant of FTO with increased BMI in an Australian adult twin population but no evidence for gene by environment (G × E) interaction / B. K. Cornes [et al.] // International Journal of Obesity. – 2009. – Vol. 33. – P. 75–79. https://doi.org/10.1038/ijo.2008.223
9. FTO variants are associated with obesity in the Chinese and Malay populations in Singapore / J. T. Tan [et al.] // Diabetes. – 2008. – Vol. 57. – P. 2851–2857. https://doi.org/10.2337/db08-0214
10. Freathy, R. M. Common variation in the FTO gene alters diabetes-related metabolic traits to the extent expected given its effect on BMI / R. M. Freathy // Diabetes. – 2008. – Vol. 57. – P. 1419–1426. https://doi.org/10.2337/db07-1466
11. Variations in the FTO gene are associated with severe obesity in the Japanese / K. Hotta [et al.] // J. Hum. Genet. – 2008. – Vol. 53, № 6. – P. 546–553. https://doi.org/10.1007/s10038-008-0283-1
12. Genetic association of SNPs in the FTO gene and predisposition to obesity in Malaysian Malays / Y.D. Apalasamy [et al.] // Braz. J. Med. Biol. Res. – 2012. – Vol. 45, № 12. – P. 1119–1126. https://doi.org/10.1590/s0100-879x2012007500134
13. Physical Activity and the Association of Common FTO Gene Variants With Body Mass Index and Obesity / E. Rampersaud [et al.] // Arch. Intern. Med. – 2008. – Vol. 168, № 16. – P. 1791–1797. https://doi.org/10.1001/archinte.168.16.1791
14. Rs7206790 and rs11644943 in FTO gene are associated with risk of obesity in Chinese school-age population / Y. Xu [et al.] // PLoS One. – 2014. – Vol. 9, № 9. – P. e108050. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0108050
15. Replication of 6 obesity genes in a meta-analysis of genome-wide association studies from diverse ancestries / L. J. Tan [et al.] // PLoS One. – 2014. – Vol. 9, № 5. – P. e96149. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0096149
16. Analysis of FTO gene variants with obesity and glucose homeostasis measures in the multiethnic Insulin Resistance Atherosclerosis Study cohort / M. R. Wing [et al.] // Int. J. Obes (Lond). – 2011. – Vol. 35, № 9. – P. 1173–1182. https://doi.org/10.1038/ijo.2010.244
17. Leptin G-2548A and leptin receptor Q223R gene polymorphisms are not associated with obesity in Romanian subjects / A. Constantin [et al.] // Biochem. Biophys. Res. Commun. – 2010. – Vol. 391. – P. 282–286. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2009.11.050
18. Effect of genetic variation in the leptin gene promoter and the leptin receptor gene on obesity risk in a population-based case-control study in Spain / O. Portoles [et al.] // Eur. J. Epidemiol. – 2006. – Vol. 21. – P. 605–612. https://doi.org/10.1007/s10654-006-9045-6
19. Variations in the obesity gene “LEPR” contribute to risk of type 2 diabetes mellitus: evidence from a meta-analysis / M. M. Yang [et al.] // Journal of diabetes research. – 2016. – Article ID 5412084. – P. 1–12. https://doi.org/10.1155/2016/5412084
##reviewer.review.form##
Праглядаў: 608
Паслаць артыкул па эл. пошце 